國內外都有一些研究，報道過特定地區、特定種類的蘑菇中的重金屬含量超標的例子，這可能與該地區是重要的工業基地，土壤、水源被污染有關。
其實蘑菇富集重金屬只是蘑菇對不良生長環境的一種自我保護機制，并不是蘑菇生長的必然結果。它們不是蘑菇生長的必需養分，對蘑菇的生長也沒有促進作用。所以，在種植中，也不會有不法商販人為添加。
蘑菇有富集重金屬的能力，但還需要有足夠的重金屬在培養基或土壤當中，供它來富集，才會發生超標的后果。蘑菇本身不會憑空產生重金屬元素。也就是說，環境好的地方，蘑菇也比較安全。因此，保護環境就是保護我們自己的食品安全。
我國的食品安全標準中早就對各種菌類食品和藥品都做出了詳細的重金屬限量規定。
我國衛生部規定的食（藥）用菌中鉛（Pb）含量的標準是：干食（藥）用菌中不高于2.0mg/kg，鮮食（藥）用菌中不高于1.0mg/kg，食（藥）用菌罐頭中Pb的含量不高于1.0mg/kg。
砷（As）含量標準是：干食（藥）用菌中不高于1.0mg/kg，鮮食（藥）用菌中不高于0.5mg/kg，食（藥）用菌罐頭中As含量不高于0.5mg/kg。
汞（Hg）的標準是：干食（藥）用菌中Hg含量不高于0.2mg/kg，鮮食（藥）用菌中Hg含量不高于0.1mg/kg，食（藥）用菌罐頭中Hg含量不高于0.1mg/kg。
所以并不是只要是蘑菇都會重金屬超標的，要關注野生和不符合種植條件的蘑菇，做好篩查檢控工作，現在隨著科技的進步，市面上的食品安全檢測儀都能適應多種情況，不論是工作環境還是食物材料，都能夠準確分析出是否符合安全衛生標準，冠宇儀器重金屬檢測儀就能簡單快速準確地檢測出食品中重金屬砷，重金屬鎘，重金屬鉻，重金屬汞，重金屬鉛等重金屬含量。為蘑菇的食品安全增加一道屏障。
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